Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBDO15205 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBDO15205 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBDO15205 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBDO15205 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBDO15205 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBDO15205 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBDO15205 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBDO15205 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBDO15205 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBDO15205 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBDO15205 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBDO15205 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBDO15205 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBDO15205 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBDO15205 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBDO15205 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBDO15205 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBDO15205 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBDO15205 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBDO15205 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBDO15205 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBDO15205 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBDO15205 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBDO15205 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBDO15205 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBDO15205 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBDO15205 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBDO15205 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBDO15205 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBDO15205 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBDO15205 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBDO15205 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBDO15205 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBDO15205 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBDO15205 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
UBDO15205 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBDO15205 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBDO15205 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBDO15205 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBDO15205 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UBDO15205 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBDO15205 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBDO15205 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBDO15205 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBDO15205 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBDO15205 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBDO15205 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBDO15205 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBDO15205 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBDO15205 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBDO15205 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBDO15205 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBDO15205 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBDO15205 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBDO15205 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBDO15205 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBDO15205 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBDO15205 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBDO15205 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBDO15205 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBDO15205 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBDO15205 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBDO15205 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBDO15205 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBDO15205 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBDO15205 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBDO15205 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBDO15205 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBDO15205 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBDO15205 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBDO15205 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBDO15205 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBDO15205 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBDO15205 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBDO15205 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBDO15205 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBDO15205 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBDO15205 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBDO15205 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBDO15205 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBDO15205 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBDO15205 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBDO15205 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBDO15205 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBDO15205 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBDO15205 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBDO15205 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBDO15205 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBDO15205 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBDO15205 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBDO15205 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBDO15205 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBDO15205 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBDO15205 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBDO15205 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBDO15205 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
UBDO15205 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBDO15205 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBDO15205 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms