Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAMP3O14828 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAMP3O14828 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms