Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 ZNF562-204ENST00000585688 1475 ntTSL 25.7□□□□□ -1.59e-9■■■■■ 45.7
DDX3XO00571 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.69e-9■■■■■ 45.7
DDX3XO00571 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.759e-9■■■■■ 45.7
DDX3XO00571 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.669e-32■■■■■ 45.7
DDX3XO00571 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.329e-32■■■■■ 45.7
DDX3XO00571 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.879e-32■■■■■ 45.7
DDX3XO00571 PIK3R2-202ENST00000426902 3273 ntTSL 218.86■□□□□ 0.611e-37■■■■■ 45.7
DDX3XO00571 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.65e-8■■■■■ 45.7
DDX3XO00571 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.262e-25■■■■■ 45.7
DDX3XO00571 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.156e-12■■■■■ 45.7
DDX3XO00571 VAMP7-201ENST00000262640 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.176e-12■■■■■ 45.7
DDX3XO00571 VAMP7-206ENST00000488344 696 ntTSL 211.24□□□□□ -0.616e-12■■■■■ 45.7
DDX3XO00571 VAMP7-203ENST00000460621 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.666e-12■■■■■ 45.7
DDX3XO00571 VAMP7-205ENST00000479687 742 ntTSL 56.89□□□□□ -1.316e-12■■■■■ 45.7
DDX3XO00571 VAMP7-204ENST00000463317 673 ntTSL 55.33□□□□□ -1.566e-12■■■■■ 45.7
DDX3XO00571 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.825e-9■■■■■ 45.6
DDX3XO00571 ZNF395-208ENST00000521912 699 ntTSL 318.99■□□□□ 0.635e-9■■■■■ 45.6
DDX3XO00571 UBIAD1-202ENST00000376810 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.324e-10■■■■■ 45.6
DDX3XO00571 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.981e-14■■■■■ 45.5
DDX3XO00571 TXNL4A-205ENST00000586295 706 ntTSL 327.44■■□□□ 1.981e-14■■■■■ 45.5
DDX3XO00571 GCAT-203ENST00000415371 552 ntTSL 422.85■■□□□ 1.256e-9■■■■■ 45.5
DDX3XO00571 GCAT-205ENST00000445195 583 ntTSL 322.85■■□□□ 1.256e-9■■■■■ 45.5
DDX3XO00571 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.546e-9■■■■■ 45.5
DDX3XO00571 GCAT-204ENST00000426858 558 ntTSL 418.14■□□□□ 0.496e-9■■■■■ 45.5
DDX3XO00571 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.446e-9■■■■■ 45.5
DDX3XO00571 GCAT-207ENST00000478203 551 ntTSL 217.75■□□□□ 0.436e-9■■■■■ 45.5
DDX3XO00571 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.262e-28■■■■■ 45.5
DDX3XO00571 GCAT-206ENST00000451984 716 ntTSL 313.9□□□□□ -0.186e-9■■■■■ 45.5
DDX3XO00571 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.861e-7■■■■■ 45.5
DDX3XO00571 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.771e-7■■■■■ 45.5
DDX3XO00571 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 45.5
DDX3XO00571 SLC38A1-203ENST00000546519 309 ntTSL 323.67■■□□□ 1.384e-7■■■■■ 45.5
DDX3XO00571 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 45.4
DDX3XO00571 SLC10A3-205ENST00000453912 1167 ntTSL 222.86■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 45.4
DDX3XO00571 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 45.4
DDX3XO00571 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 45.4
DDX3XO00571 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 45.4
DDX3XO00571 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.362e-43■■■■■ 45.3
DDX3XO00571 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.827e-8■■■■■ 45.3
DDX3XO00571 SIVA1-205ENST00000553819 856 ntTSL 317.98■□□□□ 0.477e-8■■■■■ 45.3
DDX3XO00571 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.167e-8■■■■■ 45.3
DDX3XO00571 SIVA1-208ENST00000556431 4142 ntTSL 212.09□□□□□ -0.477e-8■■■■■ 45.3
DDX3XO00571 FUT11-203ENST00000465695 2408 ntTSL 217.29■□□□□ 0.362e-9■■■■■ 45.3
DDX3XO00571 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.162e-12■■■■■ 45.3
DDX3XO00571 CENPA-206ENST00000475662 1208 ntTSL 214.66□□□□□ -0.062e-9■■■■■ 45.3
DDX3XO00571 RNASET2-209ENST00000499370 2164 ntTSL 211.94□□□□□ -0.56e-19■■■■■ 45.3
DDX3XO00571 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.461e-11■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 WDR34-205ENST00000480613 739 ntTSL 324.12■■□□□ 1.451e-20■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 WDR34-202ENST00000419989 745 ntTSL 524.12■■□□□ 1.451e-20■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 WDR34-203ENST00000451652 1039 ntTSL 222.15■■□□□ 1.141e-20■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.891e-20■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 METTL9-203ENST00000562379 701 ntTSL 219.49■□□□□ 0.711e-11■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.581e-11■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.146e-10■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.165e-8■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 CLPP-204ENST00000596149 745 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.655e-8■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 METTL9-207ENST00000567404 763 ntTSL 37.52□□□□□ -1.211e-11■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 PCGF5-202ENST00000490164 973 ntTSL 215.4■□□□□ 0.067e-15■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.487e-15■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.65e-12■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 IDS-206ENST00000466323 1529 ntTSL 1 (best)16.7■□□□□ 0.265e-12■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 AC244197.3-204ENST00000427113 906 ntTSL 314.18□□□□□ -0.145e-12■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.145e-12■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.215e-12■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 IDS-201ENST00000340855 7619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.485e-12■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 IDS-208ENST00000521702 572 ntTSL 512□□□□□ -0.495e-12■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 AC244197.3-202ENST00000441880 416 ntTSL 210.51□□□□□ -0.735e-12■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 CCPG1-212ENST00000569205 2970 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 AC244197.3-203ENST00000523759 742 ntTSL 37.85□□□□□ -1.155e-12■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 CCPG1-213ENST00000570272 570 ntTSL 47.53□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 CLPP-206ENST00000597326 480 ntTSL 513.57□□□□□ -0.243e-8■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 FAM45A-205ENST00000487888 851 ntTSL 215.12■□□□□ 0.017e-10■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.037e-10■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 FAM45A-208ENST00000493766 824 ntTSL 314.38□□□□□ -0.117e-10■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 FAM45A-202ENST00000448258 692 ntTSL 314.24□□□□□ -0.137e-10■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 FAM45A-209ENST00000497903 699 ntTSL 214.24□□□□□ -0.137e-10■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 FAM45A-204ENST00000472379 984 ntTSL 212.75□□□□□ -0.377e-10■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 ATP5O-207ENST00000487374 469 ntTSL 516.35■□□□□ 0.212e-35■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 ATP5O-208ENST00000491703 2839 ntTSL 215.17■□□□□ 0.022e-24■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 ATP5O-209ENST00000495005 586 ntTSL 210.15□□□□□ -0.782e-24■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 ATP5O-205ENST00000431254 583 ntTSL 29.65□□□□□ -0.862e-24■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 ATP5O-201ENST00000290299 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.922e-24■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 SHISA5-217ENST00000496408 571 ntTSL 418.31■□□□□ 0.527e-7■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 SHISA5-207ENST00000441507 559 ntTSL 416.74■□□□□ 0.277e-7■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 SHISA5-215ENST00000490864 565 ntTSL 416.31■□□□□ 0.27e-7■■■■■ 45.2
DDX3XO00571 SVIP-201ENST00000354193 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.55e-14■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 SVIP-203ENST00000529848 263 ntTSL 55.11□□□□□ -1.595e-14■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 C19orf66-203ENST00000585919 2079 ntTSL 223.92■■□□□ 1.427e-10■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 C19orf66-210ENST00000592551 1461 ntTSL 223.69■■□□□ 1.387e-10■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.254e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.17e-10■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 HCFC1R1-205ENST00000573842 495 ntTSL 221.72■■□□□ 1.074e-14■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.054e-14■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 HCFC1R1-209ENST00000576921 1199 ntTSL 1 (best)21.6■■□□□ 1.054e-14■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.054e-14■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 HCFC1R1-208ENST00000575214 1365 ntTSL 221.37■■□□□ 1.014e-14■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.934e-9■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.924e-14■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.866e-13■■■■■ 45.1
DDX3XO00571 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.847e-10■■■■■ 45.1
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