Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
J3KT08 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
J3KT08 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
J3KT08 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
J3KT08 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
J3KT08 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
J3KT08 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
J3KT08 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
J3KT08 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
J3KT08 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
J3KT08 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
J3KT08 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
J3KT08 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
J3KT08 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
J3KT08 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
J3KT08 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
J3KT08 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
J3KT08 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
J3KT08 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
J3KT08 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
J3KT08 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
J3KT08 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
J3KT08 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
J3KT08 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
J3KT08 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
J3KT08 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
J3KT08 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KT08 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KT08 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KT08 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KT08 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KT08 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KT08 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KT08 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KT08 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KT08 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KT08 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KT08 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KT08 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KT08 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KT08 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
J3KT08 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KT08 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KT08 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KT08 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KT08 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KT08 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KT08 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KT08 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KT08 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KT08 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KT08 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KT08 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KT08 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KT08 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KT08 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KT08 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
J3KT08 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KT08 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KT08 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KT08 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KT08 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KT08 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KT08 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KT08 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KT08 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KT08 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KT08 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KT08 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KT08 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KT08 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KT08 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KT08 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KT08 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
J3KT08 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
J3KT08 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
J3KT08 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
J3KT08 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
J3KT08 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
J3KT08 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KT08 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KT08 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KT08 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KT08 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KT08 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KT08 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KT08 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KT08 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KT08 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KT08 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KT08 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KT08 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
J3KT08 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KT08 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KT08 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KT08 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KT08 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KT08 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KT08 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
J3KT08 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms