Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BM21 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BM21 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BM21 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H3BM21 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
H3BM21 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BM21 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BM21 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BM21 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BM21 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BM21 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BM21 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BM21 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BM21 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BM21 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BM21 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BM21 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BM21 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BM21 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BM21 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BM21 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BM21 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BM21 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BM21 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BM21 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BM21 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BM21 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BM21 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BM21 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BM21 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BM21 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BM21 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BM21 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BM21 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BM21 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BM21 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BM21 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BM21 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BM21 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BM21 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BM21 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BM21 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BM21 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BM21 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BM21 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BM21 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BM21 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BM21 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BM21 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BM21 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BM21 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BM21 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BM21 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BM21 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BM21 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BM21 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BM21 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BM21 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BM21 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BM21 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BM21 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BM21 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BM21 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BM21 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BM21 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H3BM21 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BM21 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BM21 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BM21 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BM21 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BM21 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BM21 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BM21 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BM21 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BM21 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BM21 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BM21 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BM21 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BM21 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BM21 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BM21 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BM21 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BM21 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BM21 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BM21 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BM21 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BM21 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BM21 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BM21 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BM21 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BM21 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BM21 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BM21 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BM21 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BM21 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BM21 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BM21 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BM21 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BM21 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BM21 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms