Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NOTOA8MTQ0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NOTOA8MTQ0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms