Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KNCNA6PVL3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms