Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC169A6NNP5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC169A6NNP5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms