Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LIPT2A6NK58 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIPT2A6NK58 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms