Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP73A6NFT4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CFAP73A6NFT4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP73A6NFT4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms