Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4D1N5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4D1N5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4D1N5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4D1N5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4D1N5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4D1N5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
A4D1N5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4D1N5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4D1N5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4D1N5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4D1N5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4D1N5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4D1N5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4D1N5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4D1N5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4D1N5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4D1N5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4D1N5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4D1N5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4D1N5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4D1N5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
A4D1N5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4D1N5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4D1N5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4D1N5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4D1N5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4D1N5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4D1N5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4D1N5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4D1N5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4D1N5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4D1N5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4D1N5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
A4D1N5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4D1N5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4D1N5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4D1N5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4D1N5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4D1N5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4D1N5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4D1N5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4D1N5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4D1N5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4D1N5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4D1N5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4D1N5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4D1N5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4D1N5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A4D1N5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4D1N5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4D1N5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4D1N5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4D1N5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4D1N5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4D1N5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4D1N5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A4D1N5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4D1N5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4D1N5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4D1N5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4D1N5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4D1N5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4D1N5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A4D1N5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4D1N5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
A4D1N5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4D1N5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4D1N5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4D1N5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4D1N5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4D1N5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4D1N5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
A4D1N5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4D1N5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4D1N5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4D1N5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4D1N5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
A4D1N5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4D1N5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A4D1N5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
A4D1N5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4D1N5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4D1N5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4D1N5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4D1N5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4D1N5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
A4D1N5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4D1N5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4D1N5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
A4D1N5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4D1N5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4D1N5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4D1N5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4D1N5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4D1N5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4D1N5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4D1N5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4D1N5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A4D1N5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms