Protein–RNA interactions for Protein: A0A599

TCRBV5S2, T-cell receptor beta variable 5-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S2A0A599 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
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TCRBV5S2A0A599 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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TCRBV5S2A0A599 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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TCRBV5S2A0A599 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TCRBV5S2A0A599 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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TCRBV5S2A0A599 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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TCRBV5S2A0A599 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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TCRBV5S2A0A599 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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TCRBV5S2A0A599 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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TCRBV5S2A0A599 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCRBV5S2A0A599 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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