Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
A0A0J9YVX5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A0A0J9YVX5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms