Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD54BQ9Y620 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms