Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
USP15Q9Y4E8 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
USP15Q9Y4E8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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