Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
REXO2Q9Y3B8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms