Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRG3Q9Y2Y8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms