Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFR3BQ9Y2G0 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms