Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMG20BQ9P0W2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMG20BQ9P0W2 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms