Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TIMMDC1Q9NPL8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TIMMDC1Q9NPL8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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TIMMDC1Q9NPL8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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