Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
C9orf16Q9BUW7 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
C9orf16Q9BUW7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms