Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SEMA3CQ99985 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SEMA3CQ99985 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SEMA3CQ99985 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SEMA3CQ99985 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SEMA3CQ99985 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SEMA3CQ99985 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SEMA3CQ99985 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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