Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LGMNQ99538 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms