Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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