Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
RNF185Q96GF1 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
RNF185Q96GF1 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms