Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC97Q96F63 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms