Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
HDAC11Q96DB2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HDAC11Q96DB2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms