Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NKD2Q969F2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms