Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SEMA6DQ8NFY4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEMA6DQ8NFY4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms