Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 BTNL8-201ENST00000231229 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MYRIPQ8NFW9 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MYRIPQ8NFW9 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms