Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SPC24Q8NBT2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms