Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LMNTD2Q8IXW0 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms