Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STRADAQ7RTN6 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms