Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SLC24A5Q71RS6 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms