Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
WSCD1Q658N2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
WSCD1Q658N2 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms