Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PRRT3Q5FWE3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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PRRT3Q5FWE3 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PRRT3Q5FWE3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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