Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ALFQ53S48 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ALFQ53S48 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms