Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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TTLL9Q3SXZ7 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TTLL9Q3SXZ7 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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