Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC96Q2M329 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms