Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF827Q17R98 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms