Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM187BQ17R55 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 390.5 ms