Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ATP6V1FQ16864 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms