Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ATP2B3Q16720 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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