Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC110921.1-201ENST00000577544 612 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
E2F4Q16254 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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E2F4Q16254 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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E2F4Q16254 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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E2F4Q16254 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
E2F4Q16254 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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