Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TAF1AQ15573 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TAF1AQ15573 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TAF1AQ15573 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TAF1AQ15573 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TAF1AQ15573 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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