Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
R3HDM1Q15032 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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