Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SHPRHQ149N8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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