Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms