Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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FOXE3Q13461 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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FOXE3Q13461 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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FOXE3Q13461 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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FOXE3Q13461 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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FOXE3Q13461 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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FOXE3Q13461 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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FOXE3Q13461 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
FOXE3Q13461 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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FOXE3Q13461 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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FOXE3Q13461 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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FOXE3Q13461 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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FOXE3Q13461 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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