Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE3BQ13370 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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